房屋稅率提高，衝擊到「不能分割作住宅使用」的地上權住宅案，包括台北市華固「新天地」、吉美「璞立」、日勝生「京站」等，因當時向國產署標得土地，受限法令不能分割、移轉的地上權住宅案部分已完工交屋，今年5月恐需適用較高房屋稅率。

地政士公會全聯會名譽理事長王進祥表示，地上使用權住宅屋主並沒有建物所有權，房屋稅繳納是由稅捐機關開稅單給納稅義務人（建商或信託銀行），再由納稅義務人依銷售合約向房屋使用人（住戶）要，但因建物所有權人是擁有多屋或營業用的法人，就會適用3.6%或3%的房屋稅稅率。

王進祥表示，地上權住宅原本設計美意是為提供較低價格的房屋，但因持有稅大幅提高，可能造成「買地上權房屋比買所有權房屋更貴」的情形，除了可能適用較高的房屋稅率，再如一般自用住宅地價稅率為申報地價（公告地價打八折）的0.2%，但地上權住宅不僅因公有地需以公告地價作為稅基，其地租平均多為公告地價的5%，等於是鄰近房屋的25倍。